南医药学院肇始于1912年，前身为著名医学教育家颜福庆先生创立的长沙红十字会看护训练所，1924年正式建立长沙仁术护病学校。1961年从长沙搬迁至安江建立湖南省黔阳卫生学校，1981年更名为怀化地区卫生学校，1984年搬迁至怀化，2000年升格更名为怀化医学高等专科学校，2014年升格更名为湖南医药学院。

学校现有两个校区，占地面积94.53万平方米，校舍建筑总面积23.92万平方米。有教学科研仪器设备共计约1.82万件，总值约1.7亿元。近年来，学校共获批国家级、省部级等纵向科研项目258项，经费1500.9万元，横向科研项目69项，经费3475.68万元；获得省级科学技术奖8项，出版著作77本，授权国家各类专利395项，累计发表高水平科研论文533篇。学校图书馆馆藏纸质图书108.42万册、电子图书94.64万册。

学校现有教职医护员工4588人（含2所直属附属医院），其中高级职称944人，具有博士、硕士学位教师955人，享受政府特殊津贴专家3人，博士生导师2人，硕士生导师100人，培养认定临床教师3368人。学校面向全国27个省（市、自治区）招生，在校全日制大学生12164人，其中本科生11610人。

学校设有马克思主义学院、基础医学院、医学院、护理学院、药学院、公共卫生与检验医学院、康复医学与保健学院(中医学院)、口腔医学院、医学人文与信息管理学院、体育艺术学院、国际教育学院、继续教育学院、总医院（临床医学院）、第一附属医院（第一临床学院）共14个二级教学机构。

学校有国家药物临床试验机构、侗医药研究湖南省重点实验室、新型抗体药物及其智能运输系统湖南省重点实验室、中药合成生物学研究湖南省重点实验室、湖南省感染性疾病临床医疗技术示范基地、湖南省研究生培养创新实践基地、湖南省骨科康复综合性临床医疗技术示范基地、湖南省急危重症疾病临床医疗技术示范基地、湖南省呼吸与危重症疾病临床医疗技术示范基地、湖南省多发重症创伤救治临床医疗技术示范基地、湖南省心肌损伤应急处置临床医疗技术示范基地、湖南省脊柱脊髓损伤与修复临床医疗技术示范基地、互联网（中西协同）健康服务湖南省工程研究中心、湖南省社会科学创新研究基地（民族医药与民族文化研究、西部陆海新通道湘西发展战略研究）等16个省部级科研平台。怀化市重点实验室、怀化市临床医疗技术示范基地、怀化市科普基等市厅级科研平台32个。

学校现有医学、教育学、管理学3个学科门类，开设临床医学、针灸推拿学、医学影像学、口腔医学、预防医学、护理学、药学、医学检验技术、康复治疗学、医学影像技术、中药学、卫生检验与检疫、助产学、食品卫生与营养学、运动康复、健康服务与管理、市场营销、休闲体育、供应链管理19个本科专业。其中药学专业为国家级一流专业建设点，临床医学、护理学、医学检验技术、中药学、医学影像技术、健康服务与管理6个专业为省级一流专业建设点。

学校有11个实验教学中心、7个创新训练实验室、2所直属附属医院、9所非直属附属医院、34所教学医院、135个实践教学基地，其中省级实验教学示范中心3个、省级虚拟仿真实验教学中心2个、省级大学生创新创业教育中心8个、省级校企合作示范基地7个。

学校始终秉承“厚德医萃，仰天行健”的校训，恪守服务基层办学定位，培养了一大批有温度的基层健康守护者。先后获批全国卫生系统先进单位、全国学籍管理先进单位、全国五四红旗团委、湖南省文明标兵单位、湖南省就业创业示范校、湖南省实践教学管理先进单位、中国-巴基斯坦中医药中心依托单位、大湘西区域医疗卫生中心建设牵头单位、省级区域医疗中心建设单位、硕士学位授予立项建设单位。